Methods and compositions for modulating PD1
First Claim
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1. A zinc finger protein comprising four, five or six zinc finger recognition regions ordered from F1 to F4, F1 to F5 or F1 to F6, from N-terminus to C-terminus, and wherein the recognition regions comprise the following amino acid sequences:
- (i) F1;
QSGHLSR (SEQ ID NO;
11), F2;
RSDSLSV (SEQ ID NO;
2), F3;
HNDSRKN (SEQ ID NO;
3), F4;
RSDDLTR (SEQ ID NO;
4), and F5;
RSDHLTQ (SEQ ID NO;
5);
(ii) F1;
RSAALSR (SEQ ID NO;
6), F2;
RSDDLTR (SEQ ID NO;
4), F3;
RSDHLTT (SEQ ID NO;
7), F4;
DRSALSR (SEQ ID NO;
8), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);
(iii) F1;
RSAALAR (SEQ ID NO;
10), F2;
RSDDLSK (SEQ ID NO;
11), F3;
RNDHRKN (SEQ ID NO;
12), F4;
DRSALSR (SEQ ID NO;
8), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);
(iv) F1;
RSDHLSE (SEQ ID NO;
13), F2;
TSSDRTK (SEQ ID NO;
14), F3;
RSDHLSE (SEQ ID NO;
13), and F4;
QSASRKN (SEQ ID NO;
15);
(v) F1;
RSDVLSE (SEQ ID NO;
16), F2;
RSANLTR (SEQ ID NO;
17), F3;
RSDHLSQ (SEQ ID NO;
18), F4;
TSSNRKT (SEQ ID NO;
19), F5;
DRSNLSR (SEQ ID NO;
20), and F6;
RSDALAR (SEQ ID NO;
21);
or(vi) F1;
DDWNLSQ (SEQ ID NO;
22), F2;
RSANLTR (SEQ ID NO;
17), F3;
RSDHLSQ (SEQ ID NO;
18), F4;
TSSNRKT (SEQ ID NO;
19), F5;
DRSNLSR (SEQ ID NO;
20), and F6;
RSDALAR (SEQ ID NO;
21),wherein the zinc finger protein is capable of binding a target site in an endogenous human PD1 gene.
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Accused Products
Abstract
Disclosed herein are methods and compositions for modulating expression of a PD1 gene.
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41 Claims
-
1. A zinc finger protein comprising four, five or six zinc finger recognition regions ordered from F1 to F4, F1 to F5 or F1 to F6, from N-terminus to C-terminus, and wherein the recognition regions comprise the following amino acid sequences:
-
(i) F1;
QSGHLSR (SEQ ID NO;
11), F2;
RSDSLSV (SEQ ID NO;
2), F3;
HNDSRKN (SEQ ID NO;
3), F4;
RSDDLTR (SEQ ID NO;
4), and F5;
RSDHLTQ (SEQ ID NO;
5);(ii) F1;
RSAALSR (SEQ ID NO;
6), F2;
RSDDLTR (SEQ ID NO;
4), F3;
RSDHLTT (SEQ ID NO;
7), F4;
DRSALSR (SEQ ID NO;
8), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(iii) F1;
RSAALAR (SEQ ID NO;
10), F2;
RSDDLSK (SEQ ID NO;
11), F3;
RNDHRKN (SEQ ID NO;
12), F4;
DRSALSR (SEQ ID NO;
8), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(iv) F1;
RSDHLSE (SEQ ID NO;
13), F2;
TSSDRTK (SEQ ID NO;
14), F3;
RSDHLSE (SEQ ID NO;
13), and F4;
QSASRKN (SEQ ID NO;
15);(v) F1;
RSDVLSE (SEQ ID NO;
16), F2;
RSANLTR (SEQ ID NO;
17), F3;
RSDHLSQ (SEQ ID NO;
18), F4;
TSSNRKT (SEQ ID NO;
19), F5;
DRSNLSR (SEQ ID NO;
20), and F6;
RSDALAR (SEQ ID NO;
21);
or(vi) F1;
DDWNLSQ (SEQ ID NO;
22), F2;
RSANLTR (SEQ ID NO;
17), F3;
RSDHLSQ (SEQ ID NO;
18), F4;
TSSNRKT (SEQ ID NO;
19), F5;
DRSNLSR (SEQ ID NO;
20), and F6;
RSDALAR (SEQ ID NO;
21),wherein the zinc finger protein is capable of binding a target site in an endogenous human PD1 gene. - View Dependent Claims (2, 3, 4, 5)
-
-
6. A polynucleotide encoding a zinc finger protein comprising four, five or six zinc finger recognition regions ordered from F1 to F4, F1 to F5 or F1 to F6, from N-terminus to C-terminus, and wherein the recognition regions comprise the following amino acid sequences:
-
(i) F1;
QSGHLSR (SEQ ID NO;
1), F2;
RSDSLSV (SEQ ID NO;
2), F3;
HNDSRKN (SEQ ID NO;
3), F4;
RSDDLTR (SEQ ID NO;
4), and F5;
RSDHLTQ (SEQ ID NO;
5);(ii) F1;
RSAALSR (SEQ ID NO;
6), F2;
RSDDLTR (SEQ ID NO;
4), F3;
RSDHLTT (SEQ ID NO;
7), F4;
DRSALSR (SEQ ID NO;
8), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(iii) F1;
RSAALAR (SEQ ID NO;
10), F2;
RSDDLSK (SEQ ID NO;
11), F3;
RNDHRKN (SEQ ID NO;
12), F4;
DRSALSR (SEQ ID NO;
8), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(iv) F1;
RSDHLSE (SEQ ID NO;
13), F2;
TSSDRTK (SEQ ID NO;
14), F3;
RSDHLSE (SEQ ID NO;
13), and F4;
QSASRKN (SEQ ID NO;
15);(v) F1;
RSDVLSE (SEQ ID NO;
16), F2;
RSANLTR (SEQ ID NO;
17), F3;
RSDHLSQ (SEQ ID NO;
18), F4;
TSSNRKT (SEQ ID NO;
19), F5;
DRSNLSR (SEQ ID NO;
20), and F6;
RSDALAR (SEQ ID NO;
21);
or(vi) F1;
DDWNLSQ (SEQ ID NO;
22), F2;
RSANLTR (SEQ ID NO;
17), F3;
RSDHLSQ (SEQ ID NO;
18), F4;
TSSNRKT (SEQ ID NO;
19), F5;
DRSNLSR (SEQ ID NO;
20), and F6;
RSDALAR (SEQ ID NO;
21),wherein the zinc finger protein is capable of binding a target site in an endogenous human PD1 gene.
-
-
7. A polynucleotide encoding a fusion protein comprising
(a) a zinc finger protein comprising four, five or six zinc finger recognition regions ordered from F1 to F4, F1 to F5 or F1 to F6, from N-terminus to C-terminus, and wherein the recognition regions comprise the following amino acid sequences: -
(i) F1;
QSGHLSR (SEQ ID NO;
11), F2;
RSDSLSV (SEQ ID NO;
2), F3;
HNDSRKN (SEQ ID NO;
3), F4;
RSDDLTR (SEQ ID NO;
4), and F5;
RSDHLTQ (SEQ ID NO;
5);(ii) F1;
RSAALSR (SEQ ID NO;
6), F2;
RSDDLTR (SEQ ID NO;
4), F3;
RSDHLTT (SEQ ID NO;
7), F4;
DRSALSR (SEQ ID NO;
8), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(iii) F1;
RSAALAR (SEQ ID NO;
10), F2;
RSDDLSK (SEQ ID NO;
11), F3;
RNDHRKN (SEQ ID NO;
12), F4;
DRSALSR (SEQ ID NO;
8), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(iv) F1;
RSDHLSE (SEQ ID NO;
13), F2;
TSSDRTK (SEQ ID NO;
14), F3;
RSDHLSE (SEQ ID NO;
13), and F4;
QSASRKN (SEQ ID NO;
15);(v) F1;
RSDVLSE (SEQ ID NO;
16), F2;
RSANLTR (SEQ ID NO;
17), F3;
RSDHLSQ (SEQ ID NO;
18), F4;
TSSNRKT (SEQ ID NO;
19), F5;
DRSNLSR (SEQ ID NO;
20), and F6;
RSDALAR (SEQ ID NO;
21);
or(vi) F1;
DDWNLSQ (SEQ ID NO;
22), F2;
RSANLTR (SEQ ID NO;
17), F3;
RSDHLSQ (SEQ ID NO;
18), F4;
TSSNRKT (SEQ ID NO;
19), F5;
DRSNLSR (SEQ ID NO;
20), and F6;
RSDALAR (SEQ ID NO;
21),wherein the zinc finger protein is capable of binding a target site in an endogenous human PD1 gene; and (b) a functional domain.
-
-
8. A zinc finger protein comprising four or five zinc finger recognition regions ordered from F1 to F4 or F1 to F5, from N-terminus to C-terminus, and wherein the recognition regions comprise the following amino acid sequences:
-
(i) F1;
RSSALSR (SEQ ID NO;
23), F2;
RPLALKH (SEQ ID NO;
24), F3;
RNDHRKN (SEQ ID NO;
12), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(ii) F1;
QSGHLSR (SEQ ID NO;
11), F2;
RSDSLSV (SEQ ID NO;
2), F3;
HNDSRKN (SEQ ID NO;
3), F4;
RANSLLR (SEQ ID NO;
26), and F5;
RSDHLTQ (SEQ ID NO;
5);(iii) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RNNNLRT (SEQ ID NO;
29), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(iv) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
TNWHLRT (SEQ ID NO;
30), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(v) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RTPHLTL (SEQ ID NO;
31), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(vi) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RSAQLAT (SEQ ID NO;
32), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(vii) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RCTHLYl (SEQ ID NO;
33), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(viii) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RPTQRYS (SEQ ID NO;
34), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(ix) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RANHREC (SEQ ID NO;
35), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(x) F1;
RKFARPS (SEQ ID NO;
36), F2;
RNFSRSD (SEQ ID NO;
37), F3;
HPHHRMC (SEQ ID NO;
38), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xi) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RMGRLST (SEQ ID NO;
39), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xii) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RHSRLTT (SEQ ID NO;
40), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xiii) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RANHRVC (SEQ ID NO;
42), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xiv) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RSTHLLG (SEQ ID NO;
43), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xv) F1;
RNAALTR (SEQ ID NO;
45), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28) F3;
RSCGlWS (SEQ ID NO;
44), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xvi) F1;
CNAALTR (SEQ ID NO;
46), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
REEHRAT (SEQ ID NO;
47), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xvii) F1;
RNAALTR (SEQ ID NO;
45), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RHHHLAA (SEQ ID NO;
48), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xviii) F1;
RNAALTR (SEQ ID NO;
45), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RPMHLTN (SEQ ID NO;
49), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xix) F1;
RNAALTR (SEQ ID NO;
45), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RSPHLYH (SEQ ID NO;
50), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xx) F1;
RNAALTR (SEQ ID NO;
45), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RCEALHH (SEQ ID NO;
51), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSAQAR (SEQ ID NO;
52);(xxi) F1;
RNAALTR (SEQ ID NO;
45), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RCEALHH (SEQ ID NO;
51), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xxii) F1;
RNAALTR (SEQ ID NO;
45), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RlPAllS (SEQ ID NO;
53), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);
or(xxiii) F1;
HNAALTR (SEQ ID NO;
54), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RTYNRTQ (SEQ ID NO;
55), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9),wherein the zinc finger protein is capable of binding a target site in an endogenous human PD1 gene. - View Dependent Claims (9, 10, 11, 12)
-
-
13. A polynucleotide encoding a zinc finger protein comprising four or five zinc finger recognition regions ordered from F1 to F4 or F1 to F5,from N-terminus to C-terminus, and wherein the recognition regions comprise the following amino acid sequences:
-
(i) F1;
RSSALSR (SEQ ID NO;
23), F2;
RPLALKH (SEQ ID NO;
24), F3;
RNDHRKN (SEQ ID NO;
12), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(ii) F1;
QSGHLSR (SEQ ID NO;
11), F2;
RSDSLSV (SEQ ID NO;
2), F3;
HNDSRKN (SEQ ID NO;
3), F4;
RANSLLR (SEQ ID NO;
26), and F5;
RSDHLTQ (SEQ ID NO;
5);(iii) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RNNNLRT (SEQ ID NO;
29), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(iv) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
TNWHLRT (SEQ ID NO;
30), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(v) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RTPHLTL (SEQ ID NO;
31), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(vi) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RSAQLAT (SEQ ID NO;
32), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(vii) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RCTHLYL (SEQ ID NO;
33), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(viii) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RPTQRYS (SEQ ID NO;
34), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(ix) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RANHREC (SEQ ID NO;
35), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(x) F1;
RKFARPS (SEQ ID NO;
36), F2;
RNFSRSD (SEQ ID NO;
37), F3;
HPHHRMC (SEQ ID NO;
38), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xi) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RMGRLST (SEQ ID NO;
39), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xii) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RHSRLTT (SEQ ID NO;
40), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xiii) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RANHRVC (SEQ ID NO;
42), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xiv) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RSTHLLG (SEQ ID NO;
43), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xv) F1;
RNAALTR (SEQ ID NO;
45), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28) F3;
RSCGlWS (SEQ ID NO;
44), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xvi) F1;
CNAALTR (SEQ ID NO;
46), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
REEHRAT (SEQ ID NO;
47), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xvii) F1;
RNAALTR (SEQ ID NO;
45), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RHHHLAA (SEQ ID NO;
48), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xviii) F1;
RNAALTR (SEQ ID NO;
45), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RPMHLTN (SEQ ID NO;
49), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xix) F1;
RNAALTR (SEQ ID NO;
45), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RSPHLYH (SEQ ID NO;
50), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xx) F1;
RNAALTR (SEQ ID NO;
45), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RCEALHH (SEQ ID NO;
51), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSAQAR (SEQ ID NO;
52);(xxi) F1;
RNAALTR (SEQ ID NO;
45), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RCEALHH (SEQ ID NO;
51), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xxii) F1;
RNAALTR (SEQ ID NO;
45), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RLPALLS (SEQ ID NO;
53), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);
or(xxiii) F1;
HNAALTR (SEQ ID NO;
54), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RTYNRTQ (SEQ ID NO;
55), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9),wherein the zinc finger protein is capable of binding a target site in an endogenous human PD1 gene.
-
-
14. A polynucleotide encoding a fusion protein comprising
(a) a zinc finger protein comprising four or five zinc finger recognition regions ordered from F1 to F4 or F1 to F5,from N-terminus to C-terminus, and wherein the recognition regions comprise the following amino acid sequences: -
(i) F1;
RSSALSR (SEQ ID NO;
23), F2;
RPLALKH (SEQ ID NO;
24), F3;
RNDHRKN (SEQ ID NO;
12), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(ii) F1;
QSGHLSR (SEQ ID NO;
11), F2;
RSDSLSV (SEQ ID NO;
2), F3;
HNDSRKN (SEQ ID NO;
3), F4;
RANSLLR (SEQ ID NO;
26), and F5;
RSDHLTQ (SEQ ID NO;
5);(iii) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RNNNLRT (SEQ ID NO;
29), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(iv) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
TNWHLRT (SEQ ID NO;
30), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(v) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RTPHLTl (SEQ ID NO;
31), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(vi) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RSAQLAT (SEQ ID NO;
32), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(vii) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RCTHLYL (SEQ ID NO;
33), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(viii) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RPTQRYS (SEQ ID NO;
34), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(ix) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RANHREC (SEQ ID NO;
35), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(x) F1;
RKFARPS (SEQ ID NO;
36), F2;
RNFSRSD (SEQ ID NO;
37), F3;
HPHHRMC (SEQ ID NO;
38), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xi) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RMGRLST (SEQ ID NO;
39), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xii) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RHSRLTT (SEQ ID NO;
40), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xiii) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RANHRVC (SEQ ID NO;
42), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xiv) F1;
RPSTLHR (SEQ ID NO;
27), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RSTHLLG (SEQ ID NO;
43), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xv) F1;
RNAALTR (SEQ ID NO;
45), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28) F3;
RSCGLWS (SEQ ID NO;
44), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xvi) F1;
CNAALTR (SEQ ID NO;
46), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
REEHRAT (SEQ ID NO;
47), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xvii) F1;
RNAALTR (SEQ ID NO;
45), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RHHHLAA (SEQ ID NO;
48), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xviii) F1;
RNAALTR (SEQ ID NO;
45), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RPMHLTN (SEQ ID NO;
49), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xix) F1;
RNAALTR (SEQ ID NO;
45), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RSPHLYH (SEQ ID NO;
50), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xx) F1;
RNAALTR (SEQ ID NO;
45), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RCEALHH (SEQ ID NO;
51), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSAQAR (SEQ ID NO;
52);(xxi) F1;
RNAALTR (SEQ ID NO;
45), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RCEALHH (SEQ ID NO;
51), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);(xxii) F1;
RNAALTR (SEQ ID NO;
45), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RLPALLS (SEQ ID NO;
53), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9);
or(xxiii) F1;
HNAALTR (SEQ ID NO;
54), F2;
RSDELTR (SEQ ID NO;
28), F3;
RTYNRTQ (SEQ ID NO;
55), F4;
TRPVLKR (SEQ ID NO;
25), and F5;
DRSALAR (SEQ ID NO;
9),wherein the zinc finger protein is capable of binding a target site in an endogenous human PD 1 gene; and (b) a functional domain.
-
-
25. A zinc finger protein comprising five or six zinc finger recognition regions ordered from F1 to F5 or F1 to F6, from N-terminus to C-terminus, and wherein the recognition regions comprise the following amino acid sequences:
-
(i) F1;
DDWNLSQ (SEQ ID NO;
22), F2;
RSANLTR (SEQ ID NO;
17), F3;
TSGSLSR (SEQ ID NO;
61), F4;
QSGDLTR (SEQ ID NO;
62), F5;
QSSDLRR (SEQ ID NO;
63);(ii) F1;
QSSHLTR (SEQ ID NO;
64), F2;
RSDNLRE (SEQ ID NO;
65), F3;
DRSNLSR (SEQ ID NO;
20), F4;
TSSNRKT (SEQ ID NO;
19), F5;
RSDSLSK (SEQ ID NO;
66), F6;
QSANRTT (SEQ ID NO;
80);(iii) F1;
QSGDLTR (SEQ ID NO;
62), F2;
RSDNLSE (SEQ ID NO;
67), F3;
ERANRNS (SEQ ID NO;
68), F4;
DRSDLSR (SEQ ID NO;
69), F5;
QSSDLRR (SEQ ID NO;
63);
or(iv) F1;
DRSHLAR (SEQ ID NO;
70), F2;
RSDDLSR (SEQ ID NO;
7, F3;
QSANRTK (SEQ ID NO;
72), F4;
RSDTLSE (SEQ ID NO;
73), F5;
ANSNRIK (SEQ ID NO;
74),wherein the zinc finger protein is capable of binding a target site in an endogenous mouse PD1 gene. - View Dependent Claims (26, 27, 28, 29)
-
-
30. A polynucleotide encoding a zinc finger protein comprising five or six zinc finger recognition regions ordered from F1 to F5 or F1 to F6, from N-terminus to C-terminus, and wherein the recognition regions comprise the following amino acid sequences:
-
(i) F1;
DDWNLSQ (SEQ ID NO;
22), F2;
RSANLTR (SEQ ID NO;
17), F3;
TSGSLSR (SEQ ID NO;
61), F4;
QSGDLTR (SEQ ID NO;
62), F5;
QSSDLRR (SEQ ID NO;
63);(ii) F1;
QSSHLTR (SEQ ID NO;
64), F2;
RSDNLRE (SEQ ID NO;
65), F3;
DRSNLSR (SEQ ID NO;
20), F4;
TSSNRKT (SEQ ID NO;
19), F5;
RSDSLSK (SEQ ID NO;
66), F6;
QSANRTT (SEQ ID NO;
80);(iii) F1;
QSGDLTR (SEQ ID NO;
62), F2;
RSDNLSE (SEQ ID NO;
67), F3;
ERANRNS (SEQ ID NO;
68), F4;
DRSDLSR (SEQ ID NO;
69), F5;
QSSDLRR (SEQ ID NO;
63);
or(iv) F1;
DRSHLAR (SEQ ID NO;
70), F2;
RSDDLSR (SEQ ID NO;
7, F3;
QSANRTK (SEQ ID NO;
72), F4;
RSDTLSE (SEQ ID NO;
73), F5;
ANSNRIK (SEQ ID NO;
74),wherein the zinc finger protein is capable of binding a target site in an endogenous mouse PD1 gene.
-
-
31. A polynucleotide encoding a fusion protein comprising
(a) a zinc finger protein comprising five or six zinc finger recognition regions ordered from F1 to F5or F1 to F6, from N-terminus to C-terminus, and wherein the recognition regions comprise the following amino acid sequences: -
(i) F1;
DDWNLSQ (SEQ ID NO;
22), F2;
RSANLTR (SEQ ID NO;
17), F3;
TSGSLSR (SEQ ID NO;
61), F4;
QSGDLTR (SEQ ID NO;
62), F5;
QSSDLRR (SEQ ID NO;
63);(ii) F1;
QSSHLTR (SEQ ID NO;
64), F2;
RSDNLRE (SEQ ID NO;
65), F3;
DRSNLSR (SEQ ID NO;
20), F4;
TSSNRKT (SEQ ID NO;
19), F5;
RSDSLSK (SEQ ID NO;
66), F6;
QSANRTT (SEQ ID NO;
80);(iii) F1;
QSGDLTR (SEQ ID NO;
62), F2;
RSDNLSE (SEQ ID NO;
67), F3;
ERANRNS (SEQ ID NO;
68), F4;
DRSDLSR (SEQ ID NO;
69), F5;
QSSDLRR (SEQ ID NO;
63);
or(iv) F1;
DRSHLAR (SEQ ID NO;
70), F2;
RSDDLSR (SEQ ID NO;
71, F3;
QSANRTK (SEQ ID NO;
72), F4;
RSDTLSE (SEQ ID NO;
73), F5;
ANSNRIK (SEQ ID NO;
74),wherein the zinc finger protein is capable of binding a target site in an endogenous mouse PD1 gene; and (b) a functional domain. - View Dependent Claims (15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41)
-
Specification